当医院有患有传染病的病人需要手术时，医院应设有负压手术室（负压手术室是通过增设排风机调节排风量，使洁净手术室由正压变成负压。从而在洁净区域内空气负压差来控制气流，吸收有害气体，洁净室内空气。）使用这种方法可以从根本上控制和解决洁净手术室空气污染的问题。

一间通风系统正常的条件下实现负压环境，首先调节空气的排放量和供应量，实际排放量应比供应量高百分之十或者高于50立方英尺即可。这种标准能够实现至0.001英寸水位表的负压值，如不能实现负压值也不能通过增加流量额度实现，而是应该仔细检查房间内是否存在缝隙，然后采取补救措施，密封这些缝隙。

在自然条件下，空气流动方向是从高压带向低压带流动。如果手术室处于负压状态，外面的空气就会不断的通过门下的缝隙流进房间，同时防止房间内滋生的细菌、微粒逸出，进入外面的走廊。要产生负压状态，可通过通风系统来实现，让自动排出的空气多于自动提供的空气。这样就会造成房间内通风不均匀，房间通风系统不断的从房间外面吸进空气补充，

在负压室中一般会在门下设置一个缝隙（一般半英寸高）以供空气流入。除了该缝隙，这间负压室应该密封，以防空气会通过其他缝隙进入该空间，抵消房间的负压状态。

要实现负压值实际上取决于通风系统空气消耗量与供应量的差额以及房间结构的大小，包括气流路径和流动开口，密封良好的房间则很容易实现高于0.001英寸水位表的负压值。密封不好的房间就要依赖通风系统来达到负压值。