根据世界卫生组织调查，手术室的空气中含菌量与切口感染发生率成正相关。净化手术室通过应用手术室空气净化系统，同时配空调系统，可有效的控制室内的温、湿度和尘埃、细菌含量，降低手术感染。医疗净化工程是专们做层流手术室设计、施工，尤其是千级层流超净手术室，使手术室达到一定的空气洁净级别，手术环境更科学更安全，适应外科发展的需要，也为患者提供了优质的诊疗环境。

  净化并不是完全消灭细菌，而是通过过滤器除菌、除尘，必须配合地面、墙面、物体表面的清洁、消毒。并及时清理的空气过滤装置，才能确保手术中空气洁净，满足各种手术的需要。此外，还要建立科学的人流、物流流程及严格的分区管理，最终达到控制微粒污染的效果。

  层流洁净手术室离子过滤能力强，对进入手术室的空气通过初、中、高效过滤器以控制室内尘埃含量，具有除去99.97%直径0.5微米以上粒子的能力。此外，空气呈流线流入室内，以匀速通过房间后流出，室内产生的尘埃或微生物不会向四周扩散，随气流方面经回风口排出室外，可使室内空气具有一定的生物洁净度。

  层流手术室净化又分为垂直层流和水平层流。垂直层流将高效过滤器安装在房顶上，整个房顶是过滤层，气流垂直向下，回风口设在靠地面的平面上。水平层流将过滤器安装在手术病人脚端一侧墙面上，水平吹送气流，回风口设在相对一侧近墙面的房顶上。水平空气流时，手术者身体气流的阻挡，会影响手术区洁净度;垂直空气流时，切口在手术者头部的上风向，也增加了细菌污染的机会，而且投资高。一般不采用这种方式。